RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 MTHFSP49914 203 aa23.75■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 COG6Q9Y2V7 657 aa23.75■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 TNNQ9UQP3 1299 aa23.74■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.74■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 ADGRB1O14514 1584 aa23.74■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.73■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.73■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 FAM161AQ3B820 660 aa23.72■■□□□ 1.39
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PRDM12-201ENST00000253008 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.72■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.72■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.72■■□□□ 1.39
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PRDM12-201ENST00000253008 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.71■■□□□ 1.39
PRDM12-201ENST00000253008 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.7■■□□□ 1.38
PRDM12-201ENST00000253008 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.7■■□□□ 1.38
PRDM12-201ENST00000253008 SHPRHQ149N8 1683 aa23.69■■□□□ 1.38
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PRDM12-201ENST00000253008 RUNDC1Q96C34 613 aa23.68■■□□□ 1.38
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PRDM12-201ENST00000253008 IDI1Q13907 227 aa23.64■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.64■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 PDE3AQ14432 1141 aa23.62■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.62■■□□□ 1.37
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PRDM12-201ENST00000253008 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.61■■□□□ 1.37
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PRDM12-201ENST00000253008 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 NGEFQ8N5V2 710 aa23.61■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 EVC2Q86UK5 1308 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 GLI2P10070 1586 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 SEC24BO95487 1268 aa23.6■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.59■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.58■■□□□ 1.37
PRDM12-201ENST00000253008 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.57■■□□□ 1.36
PRDM12-201ENST00000253008 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PRDM12-201ENST00000253008 CFAP53Q96M91 514 aa23.56■■□□□ 1.36
PRDM12-201ENST00000253008 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.56■■□□□ 1.36
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PRDM12-201ENST00000253008 USP19O94966 1318 aa23.54■■□□□ 1.36
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PRDM12-201ENST00000253008 A0A1W2PP64 1363 aa23.53■■□□□ 1.36
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PRDM12-201ENST00000253008 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PRDM12-201ENST00000253008 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.52■■□□□ 1.36
PRDM12-201ENST00000253008 USP35Q9P2H5 1018 aa23.51■■□□□ 1.35
PRDM12-201ENST00000253008 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PRDM12-201ENST00000253008 PRAM1Q96QH2 718 aa23.49■■□□□ 1.35
PRDM12-201ENST00000253008 CCDC27Q2M243 656 aa23.49■■□□□ 1.35
PRDM12-201ENST00000253008 PIK3C2BO00750 1634 aa23.48■■□□□ 1.35
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PRDM12-201ENST00000253008 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM12-201ENST00000253008 USP32Q8NFA0 1604 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM12-201ENST00000253008 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.47■■□□□ 1.35
PRDM12-201ENST00000253008 FYB1O15117 783 aa23.46■■□□□ 1.35
PRDM12-201ENST00000253008 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.46■■□□□ 1.35
PRDM12-201ENST00000253008 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.45■■□□□ 1.35
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PRDM12-201ENST00000253008 IL27Q8NEV9 243 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.44■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 ABCC11Q96J66 1382 aa23.44■■□□□ 1.34
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PRDM12-201ENST00000253008 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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PRDM12-201ENST00000253008 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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PRDM12-201ENST00000253008 NSD2O96028 1365 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.42■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.41■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 PTPRMP28827 1452 aa23.4■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.39■■□□□ 1.34
PRDM12-201ENST00000253008 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.39■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 CABP1Q9NZU7 370 aa23.39■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.39■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.38■■□□□ 1.33
PRDM12-201ENST00000253008 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.38■■□□□ 1.33
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