RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000194530.7

STRADB-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene STRADB, Length 2,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-201ENST00000194530 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
STRADB-201ENST00000194530 RUNDC1Q96C34 613 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-201ENST00000194530 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-201ENST00000194530 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-201ENST00000194530 USP32Q8NFA0 1604 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-201ENST00000194530 NEO1Q92859 1461 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-201ENST00000194530 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.95■■□□□ 1.91
STRADB-201ENST00000194530 EVC2Q86UK5 1308 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 PDE3AQ14432 1141 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 SHPRHQ149N8 1683 aa26.93■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 PIK3C2BO00750 1634 aa26.92■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 FAM161AQ3B820 660 aa26.92■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 CFAP53Q96M91 514 aa26.92■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 GLI2P10070 1586 aa26.91■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 RAPGEF3O95398 923 aa26.9■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.89■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.89■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 MTHFSP49914 203 aa26.89■■□□□ 1.9
STRADB-201ENST00000194530 NSD2O96028 1365 aa26.89■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.89■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.88■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.88■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 WDR63Q8IWG1 891 aa26.87■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.85■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.85■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 CCDC27Q2M243 656 aa26.85■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 C8orf34Q49A92 452 aa26.85■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.84■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 ZFYVE9O95405 1425 aa26.84■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 NEUROD2Q15784 382 aa26.84■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.84■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 IDI1Q13907 227 aa26.83■■□□□ 1.89
STRADB-201ENST00000194530 USP35Q9P2H5 1018 aa26.82■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 RGS3P49796 1198 aa26.81■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.8■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 AAMPQ13685 434 aa26.79■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 CABP2Q9NPB3 220 aa26.79■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 IGHDP01880 384 aa26.78■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 PANK1Q8TE04 598 aa26.77■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 COG6Q9Y2V7 657 aa26.77■■□□□ 1.88
STRADB-201ENST00000194530 NEFMP07197 916 aa26.75■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 RICTORQ6R327 1708 aa26.74■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.74■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 ABCC11Q96J66 1382 aa26.72■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 STK26Q9P289 416 aa26.72■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.71■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
STRADB-201ENST00000194530 A0A1W2PP64 1363 aa26.7■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.7■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.69■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.69■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.68■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.67■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 ADGRB2O60241 1585 aa26.67■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.66■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 PTPRMP28827 1452 aa26.65■■□□□ 1.86
STRADB-201ENST00000194530 POGKQ9P215 609 aa26.64■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 PRAM1Q96QH2 718 aa26.63■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.63■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 RLBP1P12271 317 aa26.63■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.63■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 MED14O60244 1454 aa26.63■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.62■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 FYB1O15117 783 aa26.61■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 SLC4A3P48751 1232 aa26.61■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.61■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.6■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 TNNQ9UQP3 1299 aa26.58■■□□□ 1.85
STRADB-201ENST00000194530 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.58■■□□□ 1.84
STRADB-201ENST00000194530 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
STRADB-201ENST00000194530 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.57■■□□□ 1.84
STRADB-201ENST00000194530 ZMYM3Q14202 1370 aa26.57■■□□□ 1.84
STRADB-201ENST00000194530 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.56■■□□□ 1.84
STRADB-201ENST00000194530 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms