RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.33■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
ITGA3-201ENST00000007722 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 OFD1O75665 1012 aa16.33■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.33■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 AAMPQ13685 434 aa16.32■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.32■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.32■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 NGEFQ8N5V2 710 aa16.32■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 CFAP53Q96M91 514 aa16.32■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.31■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 PTMSP20962 102 aa16.31■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 MPNDQ8N594 471 aa16.31■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 MTHFSP49914 203 aa16.3■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 RIPK4P57078 832 aa16.3■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.3■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 PLA2R1Q13018 1463 aa16.3■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.3■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 JPH4Q96JJ6 628 aa16.3■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 ADAMTS12P58397 1594 aa16.3■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 TRIM27P14373 513 aa16.29■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 SMC5Q8IY18 1101 aa16.29■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.29■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.29■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.29■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 RNF214Q8ND24 703 aa16.29■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 PBRM1Q86U86 1689 aa16.28■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 PTPRGP23470 1445 aa16.28■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 BAG4O95429 457 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 ABCC2Q92887 1545 aa16.27■□□□□ 0.2
ITGA3-201ENST00000007722 WDR63Q8IWG1 891 aa16.27■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.26■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 SNX21Q969T3 373 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 PPP1R9BQ96SB3 815 aa16.25■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.24■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 CHD1LQ86WJ1 897 aa16.24■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.24■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 RBM25P49756 843 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.24■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.24■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 RBSNQ9H1K0 784 aa16.24■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 MAP7D2Q96T17 732 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 APBB1O00213 710 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 SLC24A1O60721 1099 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.22■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 NUP160Q12769 1436 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 NSD3Q9BZ95 1437 aa16.21■□□□□ 0.19
ITGA3-201ENST00000007722 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 DDIT3P35638 169 aa16.2■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 SYCE3A1L190 88 aa16.2■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 NUCB1Q02818 461 aa16.19■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 ZMYM3Q14202 1370 aa16.19■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 PKP1Q13835 747 aa16.19■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 TSC1Q92574 1164 aa16.18■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.18■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 PLCB2Q00722 1185 aa16.18■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 SYNMO15061 1565 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 ATP10BO94823 1461 aa16.17■□□□□ 0.18
ITGA3-201ENST00000007722 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms