RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000208091.1

Smarca2-231, Transcript of Probable global transcription activator SNF2L2, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Smarca2, Length 1,140 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Brinp3	Q499E0	766 aa		10.83	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gcgr	Q61606	485 aa		10.83	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ccnb3	Q810T2	1396 aa		10.82	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	3425401B19Rik	D3Z1D3	1412 aa		10.82	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Kif21b	Q9QXL1	1668 aa		10.82	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nhsl1	Q8CAF4	1587 aa		10.82	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Cntnap1	O54991	1385 aa		10.81	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ddx11	Q6AXC6	880 aa		10.81	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Skiv2l	Q6NZR5	1244 aa		10.81	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ptprv	P70289	1705 aa		10.81	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Eya1	P97767	591 aa		10.8	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rrp7a	Q9D1C9	280 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Kdm2b	Q6P1G2	1309 aa		10.8	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Caskin1	Q6P9K8	1431 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mypop	Q8R4U1	393 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Zbtb7c	Q8VCZ7	619 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Inpp5d	Q9ES52	1191 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Asxl1	P59598	1514 aa		10.79	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gm1043	A0A140LJC2	1431 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ttll13	A4Q9F6	804 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Cnksr2	Q80YA9	1032 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adnp2	Q8CHC8	1165 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Edaradd	Q8VHX2	208 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mbd5	B1AYB6	1498 aa		10.78	□□□□□ -0.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adgrl1	Q80TR1	1466 aa		10.77	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Kdm2a	P59997	1161 aa		10.77	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Scarf1	Q5ND28	820 aa		10.77	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Hfm1	D3Z4R1	1434 aa		10.76	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Uggt2	E9Q4X2	1504 aa		10.76	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Hmx1	O70218	332 aa		10.76	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Krtap4-1	Q3UUY3	169 aa		10.76	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ffar3	Q3UFD7	319 aa		10.75	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Col18a1	P39061	1774 aa		10.75	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adgrb2	Q8CGM1	1561 aa		10.74	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ric3	Q8BPM6	367 aa		10.74	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Onecut3	Q8K557	490 aa		10.74	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Slc12a5	Q91V14	1138 aa		10.74	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Setd1a	E9PYH6	1716 aa		10.74	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lrp6	O88572	1613 aa		10.73	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Evi5l	H3BKQ3	813 aa		10.73	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Hoxa2	P31245	372 aa		10.73	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ggt6	Q6PDE7	497 aa		10.73	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Topbp1	Q6ZQF0	1515 aa		10.73	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Fmn2	Q9JL04	1578 aa		10.73	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lipi	F6YQT7	476 aa		10.72	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Txndc2	Q6P902	515 aa		10.72	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Taok2	Q6ZQ29	1240 aa		10.72	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Thsd7a	Q69ZU6	1645 aa		10.71	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Robo2	Q7TPD3	1470 aa		10.71	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Shprh	Q7TPQ3	1674 aa		10.71	□□□□□ -0.69
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Eea1	Q8BL66	1411 aa		10.7	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Cntln	A2AM05	1397 aa		10.7	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Crim1	Q9JLL0	1037 aa		10.7	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nwd1	A6H603	1563 aa		10.69	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Kif13a	Q9EQW7	1749 aa		10.69	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Siglec1	Q62230	1695 aa		10.69	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Plch2	A2AP18	1501 aa		10.68	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Myo5c	E9Q1F5	1742 aa		10.68	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Pde8b	E9Q4S1	865 aa		10.68	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Slc7a3	P70423	618 aa		10.68	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Abca17	E9PX95	1733 aa		10.67	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Kdm5a	Q3UXZ9	1690 aa		10.66	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Prex1	Q69ZK0	1650 aa		10.66	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Slain2	Q8CI08	581 aa		10.66	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Akap12	Q9WTQ5	1684 aa		10.66	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Eif2ak4	Q9QZ05	1648 aa		10.66	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Igha	A0A0A6YXW6	389 aa		10.65	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Cdk11b	P24788	784 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Znf526	Q8BI66	675 aa		10.65	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Bcl2l12	Q9D3J3	255 aa		10.65	□□□□□ -0.7
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Zfp142	G5E869	1843 aa		10.65	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adgrb3	Q80ZF8	1522 aa		10.64	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Spag9	Q58A65	1321 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gm13695	A2AK44	830 aa		10.64	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Arid3a	Q62431	601 aa		10.64	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Oscar	Q8VBT3	265 aa		10.64	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Robo1	O89026	1612 aa		10.64	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Usp54	Q8BL06	1588 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adamts7	Q68SA9	1657 aa		10.63	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lce6a	D3YV94	81 aa		10.63	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Prrt3	Q6PE13	971 aa		10.63	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lrfn2	Q80TG9	788 aa		10.63	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Pdcd7	Q9WTY1	482 aa		10.63	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Masp1	P98064	704 aa		10.62	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Jmy	Q9QXM1	983 aa		10.62	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Arap3	Q8R5G7	1538 aa		10.62	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ankrd36	D3Z4K0	1415 aa		10.61	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Psme1	P97371	249 aa		10.61	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lhx6	Q9R1R0	363 aa		10.61	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Spryd3	E9Q9B3	442 aa		10.6	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Myo3a	Q8K3H5	1613 aa		10.59	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Itsn1	Q9Z0R4	1714 aa		10.59	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Fmr1nb	Q80ZA7	238 aa		10.59	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ybx3	Q9JKB3	361 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mast1	Q9R1L5	1570 aa		10.59	□□□□□ -0.71
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tmem131l	Q3U3D7	1597 aa		10.58	□□□□□ -0.72
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Eln	P54320	860 aa		10.58	□□□□□ -0.72
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Fhad1	A6PWD2	1420 aa		10.58	□□□□□ -0.72
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Naip1	Q9QWK5	1403 aa		10.58	□□□□□ -0.72
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adgrl2	Q8JZZ7	1487 aa		10.57	□□□□□ -0.72

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