RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	GPR182	O15218	404 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	TH	P07101	528 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	MORF4L2	Q15014	288 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	RPAIN	Q86UA6	219 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	RELL1	Q8IUW5	271 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	LPP	Q93052	612 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	HSFY1	Q96LI6	401 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	NDC80	O14777	642 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	MCF2L	O15068	1137 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	AGT	P01019	485 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	THPO	P40225	353 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	PPARD	Q03181	441 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	MGAT3	Q09327	533 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	TFDP2	Q14188	446 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	PDK2	Q15119	407 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	WSCD1	Q658N2	575 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	TEKT4	Q8WW24	435 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		21.46	■■□□□ 1.03
ME2-216	ENST00000639850	ATP2C2	O75185	946 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	GDF10	P55107	478 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	PTGIS	Q16647	500 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	LONRF1	Q17RB8	773 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	SPATA18	Q8TC71	538 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	TBCB	Q99426	244 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	SCNN1A	P37088	669 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	PTPN9	P43378	593 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	SLC8A3	P57103	927 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	C9orf72	Q96LT7	481 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	RNF157	Q96PX1	679 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		21.45	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	FAM163B	P0C2L3	166 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	RBP3	P10745	1247 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	MAGEA4	P43358	317 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	CDR1	P51861	262 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	HDAC4	P56524	1084 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	ARC	Q7LC44	396 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	PCGF5	Q86SE9	256 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	P3H4	Q92791	437 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	SENP8	Q96LD8	212 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	DUSP16	Q9BY84	665 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	MIOS	Q9NXC5	875 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	ARL5C	A6NH57	179 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	ELN	P15502	786 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	CAP1	Q01518	475 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	MFSD5	Q6N075	450 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	NPNT	Q6UXI9	565 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	FUK	Q8N0W3	1084 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	EPN3	Q9H201	632 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		21.44	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	GABRD	O14764	452 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	MDM4	O15151	490 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	CLCNKB	P51801	687 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	CCDC142	Q17RM4	750 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	PIGZ	Q86VD9	579 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	SERPINB12	Q96P63	405 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	PADI3	Q9ULW8	664 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	CLDN5	O00501	218 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	CD52	P31358	61 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		21.43	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	CAPN15	O75808	1086 aa		21.42	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	IL4R	P24394	825 aa		21.42	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	SCNN1G	P51170	649 aa		21.42	■■□□□ 1.02
ME2-216	ENST00000639850	NOMO1	Q15155	1222 aa		21.42	■■□□□ 1.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms