RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636773.1

CACNB4-233, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5 BASIC

Gene CACNB4, Length 4,143 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CD302	Q8IX05	232 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC51	Q96ER9	411 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SLX4	Q8IY92	1834 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	LAMB1	P07942	1786 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	NFASC	O94856	1347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	PDLIM1	O00151	329 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SNPH	O15079	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	COBL	O75128	1261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CDC25A	P30304	524 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	S100A5	P33763	92 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	MAPK9	P45984	424 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ACOT2	P49753	483 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SEC24C	P53992	1094 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	NR5A1	Q13285	461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SEPT6	Q14141	434 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF235	Q14590	738 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CYP4X1	Q8N118	509 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	PNKP	Q96T60	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	COQ7	Q99807	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SP110	Q9HB58	689 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	DCX	O43602	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	JAK2	O60674	1132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CRCP	O75575	148 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	IL18RAP	O95256	599 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ERVK-21	P61565	698 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	VSNL1	P62760	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CCZ1B	P86790	482 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	EVX2	Q03828	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	UBXN1	Q04323	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CHD4	Q14839	1912 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ATP9A	O75110	1047 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	SERPINB3	P29508	390 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	AP3M2	P53677	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	UBE2H	P62256	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	CENPC	Q03188	943 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	NME3	Q13232	169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	GRB14	Q14449	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CACNB4-233	ENST00000636773	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms