RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 KLRC4O43908 158 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SOAT2O75908 522 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RENBPP51606 427 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PCSK7Q16549 785 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FUT8Q9BYC5 575 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GDF3Q9NR23 364 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GID8Q9NWU2 228 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SNTG2Q9NY99 539 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LYPLA2O95372 231 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TFRCP02786 760 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MPOP05164 745 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SNHG28P0DPA3 235 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB2P25686 324 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MAP3K7CLP57077 242 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 UNC93AQ86WB7 457 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ETNPPLQ8TBG4 499 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TATDN2Q93075 761 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CD274Q9NZQ7 290 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DPP7Q9UHL4 492 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NRCAMQ92823 1304 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 H0Y626 953 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM66O15016 1216 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ERBB2P04626 1255 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 OXCT1P55809 520 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ITGA9Q13797 1035 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SRLQ86TD4 932 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LONP2Q86WA8 852 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CPA4Q9UI42 421 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RAB21Q9UL25 225 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ASTN1O14525 1302 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LACTBL1A8MY62 500 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 B3GAT3O94766 335 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LGALS2P05162 132 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CYP1A2P05177 515 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CYP2F1P24903 491 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 IRAK1P51617 712 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LZTR1Q8N653 840 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LAMB4A4D0S4 1761 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 UPP2O95045 317 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NDST1P52848 882 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PRKAA2P54646 552 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 EPHB3P54753 998 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CDH18Q13634 790 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TEX9Q8N6V9 391 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TNFRSF25Q93038 417 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM169Q96HH4 297 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NSL1Q96IY1 281 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SYT15Q9BQS2 421 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SETD4Q9NVD3 440 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ADM5C9JUS6 153 aa6.69□□□□□ -1.34
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