RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611278.4

ZNF248-208, Transcript of zinc finger protein 248, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF248, Length 4,204 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248-208ENST00000611278 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 HCSTQ9UBK5 93 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CAPN8A6NHC0 703 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 NR2F2P24468 414 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 WEE1P30291 646 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ACTN2P35609 894 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CYP4F8P98187 520 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ADAM9Q13443 819 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 AMHR2Q16671 573 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ATL2Q8NHH9 583 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 HMGB4Q8WW32 186 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ADH5P11766 374 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 FNTBP49356 437 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CDH18Q13634 790 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 SEZ6Q53EL9 994 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 SRLQ86TD4 932 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 A0A0B4J269 797 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CER1O95813 267 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ABCB4P21439 1286 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ITFG1Q8TB96 612 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 EDEM2Q9BV94 578 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 SLC25A13Q9UJS0 675 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PLXNA3P51805 1871 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ZBTB39O15060 712 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 FBXO21O94952 628 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PIGRP01833 764 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 BDNFP23560 247 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 KRT9P35527 623 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 DMC1Q14565 340 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 KRT39Q6A163 491 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 RNF19AQ9NV58 838 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CLIC2O15247 247 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 KIAA0754O94854 1291 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 HOXB2P14652 356 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CTHP32929 405 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 HNF1BP35680 557 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 DAB2P98082 770 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 SPEM2Q0P670 501 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 KCNC3Q14003 757 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ARID5BQ14865 1188 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 MYLPFQ96A32 169 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ASB16Q96NS5 453 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CENPHQ9H3R5 247 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 KRT82Q9NSB4 513 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 MIOSQ9NXC5 875 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.97□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PP2D1A8MPX8 630 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 PDXKO00764 312 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 CDK17Q00537 523 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 SLC10A6Q3KNW5 377 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 C2orf27AQ580R0 203 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 HYIQ5T013 277 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 GBP6Q6ZN66 633 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 ANO10Q9NW15 660 aa8.96□□□□□ -0.97
ZNF248-208ENST00000611278 TTC26A0AVF1 554 aa8.96□□□□□ -0.98
ZNF248-208ENST00000611278 E2F8A0AVK6 867 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms