RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 GALK1P51570 392 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ANAPC15P60006 121 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 PPP2R3AQ06190 1150 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 DPYDQ12882 1025 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 PDIA5Q14554 519 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 VEPH1Q14D04 833 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 PTPAQ15257 358 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ELF2Q15723 593 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 SPATA1Q5VX52 437 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 LRRTM3Q86VH5 581 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 GATA6Q92908 595 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 C8orf76Q96K31 380 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 GCNAQ96QF7 691 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 HSFX1Q9UBD0 423 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TBX20Q9UMR3 447 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 INVSQ9Y283 1065 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 CACNA1EQ15878 2313 aa9.46□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 LAMA1P25391 3075 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 DENND4CQ5VZ89 1909 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 SCN1AP35498 2009 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 NUP205Q92621 2012 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ANTXRLA6NF34 631 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 RHOBTB1O94844 696 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 APBB3O95704 486 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 CYP11A1P05108 521 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ADRB2P07550 413 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 NFICP08651 508 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 BCKDHBP21953 392 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 GJA4P35212 333 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 AVPR1AP37288 418 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 GPR15P49685 360 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ARSDP51689 593 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 NLRP12P59046 1061 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 BFSP1Q12934 665 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 DMC1Q14565 340 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 KRT79Q5XKE5 535 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TXNDC8Q6A555 127 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 JADE1Q6IE81 842 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 SYT13Q7L8C5 426 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 BICD1Q96G01 975 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TIPINQ9BVW5 301 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TDP1Q9NUW8 608 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 EBF1Q9UH73 591 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 OBSL1O75147 1896 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.45□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 MYH11P35749 1972 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 AKAP13Q12802 2813 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ANO9A1A5B4 782 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 PIRO00625 290 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TADA3O75528 432 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 DRD1P21728 446 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 GBP1P32455 592 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TRAPPC10P48553 1259 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 DGKEP52429 567 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 NCKAP1LP55160 1127 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 TAF12Q16514 161 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 FBXO43Q4G163 708 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 PERM1Q5SV97 790 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 SDHAF4Q5VUM1 108 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 WSCD1Q658N2 575 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 PMS2CLQ68D20 193 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 DEFB124Q8NES8 71 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.44□□□□□ -0.9
TTR-204ENST00000610404 PLIN2Q99541 437 aa9.44□□□□□ -0.9
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