RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 CDR2Q01850 454 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 GPR158Q5T848 1215 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 IRGQQ8WZA9 623 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 SMARCD2Q92925 531 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 PDCL3Q9H2J4 239 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TTC28Q96AY4 2481 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TADA3O75528 432 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ZBED1O96006 694 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TPM1P09493 284 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TKTL1P51854 596 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ZBED6P86452 979 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TMEM110Q86TL2 294 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ASB16Q96NS5 453 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TRIM5Q9C035 493 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ACP6Q9NPH0 428 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 CLIC5Q9NZA1 410 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ECI2O75521 394 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 AVPR1AP37288 418 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 HECTD3Q5T447 861 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 PMF1Q6P1K2 205 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 VSTM4Q8IW00 320 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ING5Q8WYH8 240 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 A0A0C4DFX4 3053 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 USP17L7P0C7H9 530 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 TCF3P15923 654 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 PRKCIP41743 596 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 PLCB2Q00722 1185 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 HTR4Q13639 388 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-212ENST00000596309 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 LRRC53A6NM62 1247 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 TULP2O00295 520 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 OLFM2O95897 454 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 CALCAP01258 141 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 RALAP11233 206 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 GJA1P17302 382 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 HDCP19113 662 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 SLC7A9P82251 487 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 CYP4F8P98187 520 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 ADIGQ0VDE8 80 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 PDCLQ13371 301 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 ASIC2Q16515 512 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 TXNDC8Q6A555 127 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 BEND5Q7L4P6 421 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 DRC7Q8IY82 874 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 GOLGA1Q92805 767 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 KCNK12Q9HB15 430 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 ST7Q9NRC1 585 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 GMIPQ9P107 970 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 OBSL1O75147 1896 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-212ENST00000596309 TDP1Q9NUW8 608 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms