RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CCDC169A6NNP5 214 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 C2CD2LO14523 706 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CXCL14O95715 111 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FTCDO95954 541 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 STAG3L1P0CL83 205 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 LAG3P18627 525 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CTNNA2P26232 953 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NMT1P30419 496 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 USP8P40818 1118 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GALCP54803 685 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 STRN3Q13033 797 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DRP2Q13474 957 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PGM5Q15124 567 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SURF1Q15526 300 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 XKR3Q5GH77 459 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 WDR44Q5JSH3 913 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FBXL13Q8NEE6 735 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GAB3Q8WWW8 586 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SHC3Q92529 594 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KRT12Q99456 494 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 IER2Q9BTL4 223 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ZBP1Q9H171 429 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PPCSQ9HAB8 311 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PXMP2Q9NR77 195 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TBX20Q9UMR3 447 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SCINQ9Y6U3 715 aa8.53□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 ERICH4A6NGS2 130 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 ZNF233A6NK53 670 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 PATE3B3GLJ2 98 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 NFIBO00712 420 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 CLIC2O15247 247 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 PIGRP01833 764 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 NUDT17P0C025 328 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 TGFB3P10600 412 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 C6P13671 934 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 CASP4P49662 377 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 EFNA5P52803 228 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 RPS6P62753 249 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 CLDN10P78369 228 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 DR1Q01658 176 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 CDR2Q01850 454 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 PTP4A2Q12974 167 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 TMC8Q8IU68 726 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 GPD1LQ8N335 351 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 PPTC7Q8NI37 304 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 PHF12Q96QT6 1004 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 FMO2Q99518 471 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 SETD4Q9NVD3 440 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GGA3-218ENST00000584243 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.52□□□□□ -1.05
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