RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TSSK4Q6SA08 328 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CPA6Q8N4T0 437 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TTC39CQ8N584 583 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA4DQ92854 862 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TATDN2Q93075 761 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CEP63Q96MT8 703 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TWNKQ96RR1 684 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SMOQ99835 787 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 RNF38Q9H0F5 515 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CISHQ9NSE2 258 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 GCNT4Q9P109 453 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CPQQ9Y646 472 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.81□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 FAM186AA6NE01 2351 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 PROB1E7EW31 1015 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CILPO75339 1184 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 GNA14O95837 355 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CXCL12P48061 93 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CCR3P51677 355 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SLC8A3P57103 927 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 INCA1Q0VD86 236 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 PAK1Q13153 545 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 FZD5Q13467 585 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF77Q15935 545 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 HECTD3Q5T447 861 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 RIN3Q8TB24 985 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ATP2A3Q93084 1043 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM176AQ96HP8 235 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 HINFPQ9BQA5 517 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CHRDQ9H2X0 955 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ECT2Q9H8V3 914 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 HPS4Q9NQG7 708 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 COMMD8Q9NX08 183 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 GMIPQ9P107 970 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.8□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 PRR23AA6NEV1 266 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF10BO14763 440 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 NFATC1O95644 943 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CD19P15391 556 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 BMP6P22004 513 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 GJA4P35212 333 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 FMO5P49326 533 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 GALK1P51570 392 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 NRLP54845 237 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A9P82251 487 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CUL2Q13617 745 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TTI2Q6NXR4 508 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 WHAMMQ8TF30 809 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35C1Q96A29 364 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 ARID3AQ99856 593 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 IER2Q9BTL4 223 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.79□□□□□ -1
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms