RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa29.76■■■□□ 2.36
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXO21O94952 628 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 HDAC4P56524 1084 aa29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP11AP98196 1134 aa29.71■■■□□ 2.35
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