RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569270.5

CHTF18-218, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-218ENST00000569270 GMIPQ9P107 970 aa20.5■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 ANTXRLA6NF34 631 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 K7EQS6 105 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 IKBKBO14920 756 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 RHOBTB3O94955 611 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 ASS1P00966 412 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 HLA-DRAP01903 254 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 NR2F2P24468 414 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 ASPAP45381 313 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 DPYDQ12882 1025 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 HECTD3Q5T447 861 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 C12orf29Q8N999 325 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.49■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 GDF9O60383 454 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 AKAP3O75969 853 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 BEST1O76090 585 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 ADH1CP00326 375 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 TRIM49P0CI25 452 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 TRIM49CP0CI26 452 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 SLC6A11P48066 632 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 GCLMP48507 274 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 MAP3K7CLP57077 242 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 USP33Q8TEY7 942 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 LOXL4Q96JB6 756 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 SMOQ99835 787 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 NACA2Q9H009 215 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 IL37Q9NZH6 218 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.48■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 CACNA1AO00555 2505 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 A0A1W2PQ27 194 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 A0A1W2PQ64 194 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 A0A1W2PQD8 194 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 DCLK1O15075 740 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 EPN2O95208 641 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 KRT13P13646 458 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 ADORA2BP29275 332 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 UNC93AQ86WB7 457 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 SFTPA1Q8IWL2 248 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 COMMD8Q9NX08 183 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.47■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 E2F8A0AVK6 867 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 SLC30A4O14863 429 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 MAPK13O15264 365 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 FAM200BP0CF97 657 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 IRF1P10914 325 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 ADH5P11766 374 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 DGKEP52429 567 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 PPP3CAQ08209 521 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 MESP2Q0VG99 397 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 PLK5Q496M5 336 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 C12orf40Q86WS4 652 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 TWNKQ96RR1 684 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 PNKPQ96T60 521 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 EBF1Q9UH73 591 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 INVSQ9Y283 1065 aa20.46■□□□□ 0.87
CHTF18-218ENST00000569270 CEP250Q9BV73 2442 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 FAM92AA1XBS5 289 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF202O95125 648 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 CD58P19256 250 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 PGFP49763 221 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 TUBP50607 506 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 KDSRQ06136 332 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 ADAM9Q13443 819 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 NFIL3Q16649 462 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 ANO7Q6IWH7 933 aa20.45■□□□□ 0.86
CHTF18-218ENST00000569270 TTC30AQ86WT1 665 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms