RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 ASPAP45381 313 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 HECTD3Q5T447 861 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 UNC93AQ86WB7 457 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 OVCA2Q8WZ82 227 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.21■■□□□ 1.15
PPP4C-211ENST00000567642 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 TNFRSF10BO14763 440 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ADORA2BP29275 332 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 MAP3K7CLP57077 242 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 LMNB2Q03252 620 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 PPP3CAQ08209 521 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 BECN1Q14457 450 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 C12orf29Q8N999 325 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 HHIPQ96QV1 700 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SMOQ99835 787 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 GMIPQ9P107 970 aa22.2■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 COCHO43405 550 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 BEST1O76090 585 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CYP17A1P05093 508 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC192P0DO97 292 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 TGM1P22735 817 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 OPRD1P41143 372 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 PNOCQ13519 176 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 NACA2Q9H009 215 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 COMMD8Q9NX08 183 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.19■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CD58P19256 250 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SEC13P55735 322 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP8P85298 464 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 DHCR24Q15392 516 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 GAB3Q8WWW8 586 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ACDQ96AP0 544 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 TWNKQ96RR1 684 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CEP250Q9BV73 2442 aa22.18■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 FAM200BP0CF97 657 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SDHBP21912 280 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 DMC1Q14565 340 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 C2orf27AQ580R0 203 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SYT13Q7L8C5 426 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 RMND1Q9NWS8 449 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 IL37Q9NZH6 218 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 E2F8A0AVK6 867 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 AXIN1O15169 862 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CETN3O15182 167 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 LRP3O75074 770 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 IRF1P10914 325 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SLC6A11P48066 632 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ENPEPQ07075 957 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 INCA1Q0VD86 236 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 GAB4Q2WGN9 574 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 KRT39Q6A163 491 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.16■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ADH1CP00326 375 aa22.15■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.15■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 TUBP50607 506 aa22.15■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.15■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PPP4C-211ENST00000567642 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms