RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	SYNC	Q9H7C4	482 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TCF4-231	ENST00000566279	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
TCF4-231	ENST00000566279	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TCF4-231	ENST00000566279	INSL6	Q9Y581	213 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TCF4-231	ENST00000566279	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		10.65	□□□□□ -0.7
TCF4-231	ENST00000566279	LINC01553	A4QN01	128 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	DDHD2	O94830	711 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	LINC00271	P0C7V0	271 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SKI	P12755	728 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PTPN7	P35236	360 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ADCY2	Q08462	1091 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ZNF844	Q08AG5	666 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PTK6	Q13882	451 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CCNG2	Q16589	344 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	XKR4	Q5GH76	650 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	C12orf29	Q8N999	325 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PIR	O00625	290 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TP73	O15350	636 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	LRCH4	O75427	683 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	KRT10	P13645	584 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	KCNE1	P15382	129 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	EMC1	Q8N766	993 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CWH43	Q9H720	699 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	EPOP	A6NHQ4	379 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	RFXAP	O00287	272 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	IVD	P26440	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CDKN2B	P42772	138 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PMS2	P54278	862 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	COPS2	P61201	443 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	KCTD16	Q68DU8	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279		Q7L0L9	218 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ACOT1	Q86TX2	421 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ATL2	Q8NHH9	583 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TIFA	Q96CG3	184 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CCDC114	Q96M63	670 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	WHRN	Q9P202	907 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279		A0A1W2PPC1	479 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	GAS8	O95995	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	IL1R2	P27930	398 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	CETN2	P41208	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	STIL	Q15468	1287 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	KAZN	Q674X7	775 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	FIBCD1	Q8N539	461 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TCF4-231	ENST00000566279	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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