RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559937.1

SMAD3-212, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-212ENST00000559937 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.45□□□□□ -1.06
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SMAD3-212ENST00000559937 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.44□□□□□ -1.06
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SMAD3-212ENST00000559937 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.43□□□□□ -1.06
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