RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	P4HA2	O15460	535 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	CALCA	P01258	141 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	CD19	P15391	556 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	PFKL	P17858	780 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	SLC7A9	P82251	487 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	PDGFRL	Q15198	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	RRAGA	Q7L523	313 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TTC30A	Q86WT1	665 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	MSANTD3	Q96H12	275 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	NELL2	Q99435	816 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	COMMD8	Q9NX08	183 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	F5	P12259	2224 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	NCAM2	O15394	837 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	CHRNB1	P11230	501 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TCF3	P15923	654 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	CETN1	Q12798	172 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	EML3	Q32P44	896 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM270	Q6UE05	265 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642		Q6ZS52	159 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	OSER1	Q9NX31	292 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642		A0A1W2PQH9	124 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TULP2	O00295	520 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TLR5	O60602	858 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	IRF1	P10914	325 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	MAGEA9	P43362	315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	MRE11	P49959	708 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TUB	P50607	506 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	KIF11	P52732	1056 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	APBA1	Q02410	837 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	MTAP	Q13126	283 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	WBP2	Q969T9	261 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	NACA2	Q9H009	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642		O00370	1275 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	MDM4	O15151	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TBX18	O95935	607 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	SP9	P0CG40	484 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	GJA4	P35212	333 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	BCAT1	P54687	386 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	PDE4C	Q08493	712 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	LRRC32	Q14392	662 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	GAS6	Q14393	721 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BMP4-208	ENST00000559642	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.59	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.2 ms