RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	GPNMB	Q14956	572 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	EMC2	Q15006	297 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB30	Q15771	203 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	IL17A	Q16552	155 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TCTN1	Q2MV58	587 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	STEAP3	Q658P3	488 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	C4orf19	Q8IY42	314 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	APBB2	Q92870	758 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TIFA	Q96CG3	184 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	YME1L1	Q96TA2	773 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAM2	Q99965	735 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PRO3102	Q9H379	93 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	IPPK	Q9H8X2	491 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MTMR6	Q9Y217	621 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	KRIT1	O00522	736 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ASAP2	O43150	1006 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CAND2	O75155	1236 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR32	O75388	356 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	BAIAP3	O94812	1187 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ERLIN2	O94905	339 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	STBD1	O95210	358 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ASMTL	O95671	621 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TSPAN15	O95858	294 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CXCL10	P02778	98 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	KRT1	P04264	644 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CA3	P07451	260 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	STAG3L1	P0CL83	205 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	COL6A2	P12110	1019 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PFKL	P17858	780 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	NAT1	P18440	290 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	RPA1	P27694	616 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CA8	P35219	290 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	GPC3	P51654	580 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MGAT3	Q09327	533 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	REST	Q13127	1097 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PDILT	Q8N807	584 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	USP38	Q8NB14	1042 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF149	Q8NC42	400 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	NEK9	Q8TD19	979 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	IFT74	Q96LB3	600 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	APOL6	Q9BWW8	343 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CSRNP2	Q9H175	543 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	INSL6	Q9Y581	213 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	IRAK3	Q9Y616	596 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
ATXN3-238	ENST00000556288	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		5.12	□□□□□ -1.59

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