RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PSMD9	O00233	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PHKG2	P15735	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	UQCRC1	P31930	480 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TIRAP	P58753	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MLC1	Q15049	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	NPY5R	Q15761	445 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007		H3BNC9	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FCHO1	O14526	889 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MT-CO3	P00414	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	HRG	P04196	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	A1BG	P04217	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MMP13	P45452	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	LMAN2	Q12907	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	VPS16	Q9H269	839 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	MYB	P10242	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	IL1R2	P27930	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ARHGAP25	P42331	645 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	NR4A2	P43354	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CACNB3	P54284	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CNGA2	Q16280	664 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007		A6NNZ2	444 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CES2	O00748	559 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SPRY2	O43597	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	BMP15	O95972	392 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	DIO1	P49895	249 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	TWIST1	Q15672	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	APIP	Q96GX9	242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CCDC17	Q96LX7	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TIMM9-208	ENST00000556007	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TIMM9-208	ENST00000556007	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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