RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TULP2O00295 520 aa13.58□□□□□ -0.24
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa13.58□□□□□ -0.24
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 UBASH3AP57075 661 aa13.58□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TDGQ13569 410 aa13.58□□□□□ -0.24
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.241e-9■■□□□ 14.1
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TRPC7Q9HCX4 862 aa13.58□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NLRC4Q9NPP4 1024 aa13.58□□□□□ -0.24
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa13.58□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 COL4A2P08572 1712 aa13.58□□□□□ -0.24
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 ALADP13716 330 aa13.57□□□□□ -0.24
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa13.57□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FMNL3Q8IVF7 1028 aa13.57□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC44A3Q8N4M1 653 aa13.57□□□□□ -0.24
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TDP1Q9NUW8 608 aa13.56□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HEPACAM2A8MVW5 462 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PI4K2BG5E9Z4 385 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DPYSL4O14531 572 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FBXO21O94952 628 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CFHP08603 1231 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SRFP11831 508 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TCF3P15923 654 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PSMC3P17980 439 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ACADSBP45954 432 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RGS7P49802 495 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC7A9P82251 487 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZXDAP98168 799 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FCHO2Q0JRZ9 810 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PDCLQ13371 301 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VITQ6UXI7 678 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TADA2BQ86TJ2 420 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MFSD6LQ8IWD5 586 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF276Q8N554 614 aa13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
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