RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.49□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 XPR1Q9UBH6 696 aa6.49□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 RAD54BQ9Y620 910 aa6.49□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.49□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 NSD2O96028 1365 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A087WWL8 130 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A0B4J269 797 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 BTN3A1O00481 513 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 PROM1O43490 865 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 GCP02774 474 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 ITGALP20701 1170 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 PEX2P28328 305 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 ADRA1BP35368 520 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 AVPR1BP47901 424 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM193AP78312 1265 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 TUBB3Q13509 450 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 SEMA5AQ13591 1074 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 LONRF3Q496Y0 759 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 VWA1Q6PCB0 445 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 Q6ZNX1 250 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 TOR3AQ9H497 397 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.48□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 F5H697 171 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 GOLIM4O00461 696 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 RAMP2O60895 175 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 SOAT2O75908 522 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 ESRRBO95718 433 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 THP07101 528 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 MYF5P13349 255 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 TYRP1P17643 537 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 VIPR2P41587 438 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 COL10A1Q03692 680 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 CTBP1Q13363 440 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 MPP3Q13368 585 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 VPS53Q5VIR6 699 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 CAVIN3Q969G5 261 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 CHFRQ96EP1 664 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 AGAP2Q99490 1192 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 MRIQ9BWK5 157 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 TPCN1Q9ULQ1 816 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 TMX2Q9Y320 296 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 C4BP0C0L5 1744 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.47□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 NFAT5O94916 1531 aa6.46□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 ITGB4P16144 1822 aa6.46□□□□□ -1.37
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A087X1B8 175 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM233B4DJY2 109 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 BCL9O00512 1426 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 LILRA4P59901 499 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC13A2Q13183 592 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC15A4Q8N697 577 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 APIPQ96GX9 242 aa6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 ISM1B1AKI9 464 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 YY2O15391 372 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 TRIAP1O43715 76 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 BRAFP15056 766 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 CD6P30203 668 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 PLA2G5P39877 138 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 LOXL3P58215 753 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 TGFB2P61812 414 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 IQCB1Q15051 598 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 CNGA2Q16280 664 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 MICU3Q86XE3 530 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 GPR150Q8NGU9 434 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 ABHD8Q96I13 439 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 DMTF1Q9Y222 760 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 CACNA1SQ13698 1873 aa6.45□□□□□ -1.38
AC009396.1-201ENST00000553628 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms