RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 IL12RB1P42701 662 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MAPKAPK2P49137 400 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ITKQ08881 620 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZMYND11Q15326 602 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2SQ16763 222 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SARM1Q6SZW1 724 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TLDC2A0PJX2 215 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 NBNO60934 754 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EYA4O95677 639 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ART3Q13508 389 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF699Q32M78 642 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf22Q49AR2 442 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TTC23LQ6PF05 361 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TMC2Q8TDI7 906 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF521Q96K83 1311 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLC32A1Q9H598 525 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IFNKQ9P0W0 207 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CENPBD1B2RD01 187 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 INPP1P49441 399 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MCL1Q07820 350 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 CGREF1Q99674 301 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JPF8 293 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF12P17014 697 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EPHB3P54753 998 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 GNG2P59768 71 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 SSX2Q16385 188 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PTGISQ16647 500 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 Q3ZCU0 254 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 EMBQ6PCB8 327 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 BTBD18B2RXH4 712 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM114B3SHH9 223 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 VWA5AO00534 786 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NEMP1O14524 444 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GFPT2O94808 682 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FAM107AO95990 144 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CD9P21926 228 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NR2F2P24468 414 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GGCXP38435 758 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SCTRP47872 440 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 STARP49675 285 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CASP5P51878 434 aa6.53□□□□□ -1.36
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