RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 DGKDQ16760 1214 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RNF151Q2KHN1 245 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 NXNQ6DKJ4 435 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 KCNV1Q6PIU1 500 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 POLNQ7Z5Q5 900 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CATIPQ7Z7H3 387 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 LCORLQ8N3X6 602 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 NRG4Q8WWG1 115 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 DYDC2Q96IM9 177 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CSRNP2Q9H175 543 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 BOLA2Q9H3K6 86 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ACAD9Q9H845 621 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 KCNG1Q9UIX4 513 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 WDR19Q8NEZ3 1342 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MYH4Q9Y623 1939 aa4.85□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 DOCK3Q8IZD9 2030 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 E2F8A0AVK6 867 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 F5H6K3 240 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MATN2O00339 956 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GAAP10253 952 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 EEF2P13639 858 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CCND1P24385 295 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CTGFP29279 349 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MCM7P33993 719 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ETV4P43268 484 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CPT1AP50416 773 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 KLRC3Q07444 240 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MGAT5Q09328 741 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TRDNQ13061 729 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 IKQ13123 557 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PLS1Q14651 629 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 MLC1Q15049 377 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PCOLCEQ15113 449 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CTR9Q6PD62 1173 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZVL8 140 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 DGKHQ86XP1 1220 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PRR18Q8N4B5 295 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM199Q8N511 208 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 AMER2Q8N7J2 671 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SDR42E1Q8WUS8 393 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 ESR2Q92731 530 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 CHFRQ96EP1 664 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 KRT23Q9C075 422 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 PORCNQ9H237 461 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 STAP2Q9UGK3 403 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.84□□□□□ -1.63
HDAC2-216ENST00000523628 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ERICH2A1L162 156 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 A6NNZ2 444 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CDC14BO60729 498 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 STAM2O75886 525 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ICAM1P05362 532 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 POU2F2P09086 479 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CLTBP09497 229 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 TOP1P11387 765 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 GUCY1A2P33402 732 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 WASP42768 502 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SLC6A9P48067 706 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 GPR15P49685 360 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 RRADP55042 308 aa4.83□□□□□ -1.64
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