RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	PMM2	O15305	246 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	COCH	O43405	550 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TBX18	O95935	607 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CHRNB1	P11230	501 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC7A9	P82251	487 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	RUNX3	Q13761	415 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	EML3	Q32P44	896 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TSSK4	Q6SA08	328 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555		Q6ZS52	159 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TFAP2B	Q92481	460 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PRRX2	Q99811	253 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	DUSP16	Q9BY84	665 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1W2PQH9	124 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	GNA14	O95837	355 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CCDC192	P0DO97	292 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TCF3	P15923	654 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC9A1	P19634	815 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	KIF11	P52732	1056 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	NUBP1	P53384	320 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MTAP	Q13126	283 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	GAB4	Q2WGN9	574 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM270	Q6UE05	265 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SCD5	Q86SK9	330 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PIGZ	Q86VD9	579 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MLKL	Q8NB16	471 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	NT5C1B	Q96P26	610 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ECT2	Q9H8V3	914 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	ACP6	Q9NPH0	428 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	EHD2	Q9NZN4	543 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555		O00370	1275 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MAN2B1	O00754	1011 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	P4HA2	O15460	535 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TLR5	O60602	858 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	GABBR2	O75899	941 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SP9	P0CG40	484 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	IRF1	P10914	325 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CD19	P15391	556 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	GJA4	P35212	333 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP3CC	P48454	512 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	IFNAR2	P48551	515 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PDE4C	Q08493	712 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	MESP2	Q0VG99	397 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CCIN	Q13939	588 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PKDCC	Q504Y2	493 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	RAB41	Q5JT25	222 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	HECTD3	Q5T447	861 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	COMMD8	Q9NX08	183 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PABPC1-222	ENST00000523555	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		10.04	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms