RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522968.1

UBXN8-205, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-205ENST00000522968 DAOAP59103 153 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 COPS2P61201 443 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 ATP11AP98196 1134 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 CDO1Q16878 200 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 ODF2Q5BJF6 829 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 WDR93Q6P2C0 686 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 RUBCNQ92622 972 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 FAM149B1Q96BN6 582 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 CNGB3Q9NQW8 809 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 USP18Q9UMW8 372 aa11.96□□□□□ -0.49
UBXN8-205ENST00000522968 RAD51CO43502 376 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 PHF2O75151 1096 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 RARAP10276 462 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 RALAP11233 206 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 MCM3P25205 808 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 PTPN7P35236 360 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 MATKP42679 507 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 SLC7A5Q01650 507 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 BRD3Q15059 726 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 LLGL1Q15334 1064 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 CYP1B1Q16678 543 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 RAB6CQ53S08 254 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 DEFB106AQ8N104 65 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 SCML4Q8N228 414 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 PRELID2Q8N945 189 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 CCDC26Q8TAB7 109 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 HDAC7Q8WUI4 952 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 RAPGEF5Q92565 580 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 B3GALT6Q96L58 329 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 SLC2A13Q96QE2 648 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 PEBP4Q96S96 227 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 TTPALQ9BTX7 342 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 RAB6CQ9H0N0 254 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.95□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 LRRD1A4D1F6 860 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 PRPSAP2O60256 369 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 TBC1D4O60343 1298 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 EFEMP2O95967 443 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 ZBED1O96006 694 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 USP17L7P0C7H9 530 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 KDELR1P24390 212 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 CYP2F1P24903 491 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 CHRNA3P32297 505 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 NOS2P35228 1153 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 GRIK1P39086 918 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 HDAC4P56524 1084 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 VSNL1P62760 191 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 RTP2Q5QGT7 225 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 VSTM1Q6UX27 236 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 OTOP2Q7RTS6 562 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 TAS1R1Q7RTX1 841 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.94□□□□□ -0.5
UBXN8-205ENST00000522968 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms