RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NADK2Q4G0N4 442 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf228Q6PIY5 440 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 RHBDF2Q6PJF5 856 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PDSS2Q86YH6 399 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 HACE1Q8IYU2 909 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 FNDC8Q8TC99 324 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf54Q8WWF1 131 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SLC5A5Q92911 643 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
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TRPS1-211ENST00000520276 TXNDC9O14530 226 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 DLATP10515 647 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 COG7P83436 770 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 KRT17Q04695 432 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ACAP1Q15027 740 aa10.53□□□□□ -0.72
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF484Q5JVG2 852 aa10.53□□□□□ -0.72
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TRPS1-211ENST00000520276 STK17AQ9UEE5 414 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ASIC3Q9UHC3 531 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRA2Q96PE1 1338 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 POTEFA5A3E0 1075 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ZBBXA8MT70 800 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 H0YCG3 227 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFB5O43674 189 aa10.53□□□□□ -0.72
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TRPS1-211ENST00000520276 ZWINTO95229 277 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CTSHP09668 335 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CYBAP13498 195 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CA4P22748 312 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 CYP3A7P24462 503 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ECM1Q16610 540 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 KCTD21Q4G0X4 260 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 POTEGQ6S5H5 508 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 TRABD2AQ86V40 505 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ATP11CQ8NB49 1132 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R14BQ96C90 147 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 H3BRJ5 948 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PLA2G4BP0C869 781 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ATP6V1B1P15313 513 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 VCLP18206 1134 aa10.53□□□□□ -0.72
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC5A2P31639 672 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PSMD7P51665 324 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ITGA8P53708 1063 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ITGA7Q13683 1181 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PADI6Q6TGC4 694 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC6Q86X45 466 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ZBED8Q8IZ13 594 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 RNF169Q8NCN4 708 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PYDC1Q8WXC3 89 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ATG4AQ8WYN0 398 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf49Q9H6J7 331 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SIX2Q9NPC8 291 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SETD4Q9NVD3 440 aa10.53□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PHIPQ8WWQ0 1821 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 MMP3P08254 477 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 TFPTP0C1Z6 253 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 ACLYP53396 1101 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 PDK3Q15120 406 aa10.52□□□□□ -0.72
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TRPS1-211ENST00000520276 VPS36Q86VN1 386 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 IRGQQ8WZA9 623 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SH2D3AQ9BRG2 576 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.72
TRPS1-211ENST00000520276 NCANO14594 1321 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PPM1 405 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 A8MXQ7 604 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 INSRRP14616 1297 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 THPOP40225 353 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 JAM2P57087 298 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 CDC42EP1Q00587 391 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 MYLK3Q32MK0 819 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 UGT2A3Q6UWM9 527 aa10.52□□□□□ -0.73
TRPS1-211ENST00000520276 RGS9BPQ6ZS82 235 aa10.52□□□□□ -0.73
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