RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
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SH3BP2-218ENST00000511185 MAN2B1O00754 1011 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 GNA14O95837 355 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 APBA1Q02410 837 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 RUNX3Q13761 415 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 EML3Q32P44 896 aa19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 PDZD8Q8NEN9 1154 aa19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 OVCA2Q8WZ82 227 aa19.76■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 WBP2Q969T9 261 aa19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP16Q9BY84 665 aa19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 NMUR1Q9HB89 426 aa19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 TCF3P15923 654 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP3CCP48454 512 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 GAS6Q14393 721 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP17Q68EM7 881 aa19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf210Q8IVY1 113 aa19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZSWIM1Q9BR11 485 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00597Q9H2U6 94 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 TSPAN16Q9UKR8 245 aa19.75■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 MDM4O15151 490 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 P4HA2O15460 535 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 CD19P15391 556 aa19.74■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS9P46781 194 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 SNX30Q5VWJ9 437 aa19.74■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 NUDT5Q9UKK9 219 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQH9 124 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 TBX18O95935 607 aa19.73■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 KIF11P52732 1056 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 HECTD3Q5T447 861 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 GJB7Q6PEY0 223 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 TSSK4Q6SA08 328 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGZQ86VD9 579 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO44Q9H4M3 255 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 ECT2Q9H8V3 914 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 C2orf42Q9NWW7 574 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 COMMD8Q9NX08 183 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 SCML2Q9UQR0 700 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 O00370 1275 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 TLR5O60602 858 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 IRF1P10914 325 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 BRD2P25440 801 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXC13P31276 330 aa19.72■□□□□ 0.75
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SH3BP2-218ENST00000511185 MRE11P49959 708 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBP50607 506 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 CCINQ13939 588 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 GAB4Q2WGN9 574 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 SGO2Q562F6 1265 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 FSTL4Q6MZW2 842 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 PKN3Q6P5Z2 889 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 SCD5Q86SK9 330 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 EHBP1Q8NDI1 1231 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 NELL2Q99435 816 aa19.72■□□□□ 0.75
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