RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 HDAC9Q9UKV0 1011 aa5.7□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.7□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 FANCAO15360 1455 aa5.7□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 SMIM22K7EJ46 135 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 M0R3H8 397 aa5.69□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 RNF220Q5VTB9 566 aa5.69□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.69□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.69□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.68□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 HRGP04196 525 aa5.68□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 STK31Q9BXU1 1019 aa5.68□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 SNX14Q9Y5W7 946 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.68□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa5.67□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 SP2Q02086 613 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 SLC29A2Q14542 456 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.67□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 APIPQ96GX9 242 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.67□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa5.67□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 PLCH2O75038 1416 aa5.66□□□□□ -1.5
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RBM39-241ENST00000496183 ATF3P18847 181 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CTGFP29279 349 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 CYP4F2P78329 520 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 E2F1Q01094 437 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 ARHGEF7Q14155 803 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 GBX1Q14549 363 aa5.66□□□□□ -1.5
RBM39-241ENST00000496183 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.66□□□□□ -1.5
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