RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM35AQ86V20 835 aa23.95■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.95■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SMOC1Q9H4F8 434 aa23.95■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 IL37Q9NZH6 218 aa23.95■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 E2F8A0AVK6 867 aa23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TUBP50607 506 aa23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC9A9Q8IVB4 645 aa23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 OTUB2Q96DC9 234 aa23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 PNKPQ96T60 521 aa23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 DMAC2Q9NW81 257 aa23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 COMMD8Q9NX08 183 aa23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP45Q9UL16 551 aa23.94■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TNFRSF10BO14763 440 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 KLRC4O43908 158 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SLFN14P0C7P3 912 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 GBP1P32455 592 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CDH8P55286 799 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CREB5Q02930 508 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CRY1Q16526 586 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 PMS2CLQ68D20 193 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 RHBDF2Q6PJF5 856 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNK16Q96T55 309 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 MED10Q9BTT4 135 aa23.93■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A0A0MRY4 1105 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM92AA1XBS5 289 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 COCHO43405 550 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 KAT7O95251 611 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CAVIN2O95810 425 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 APODP05090 189 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ADH5P11766 374 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 P4HA1P13674 534 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC5A3P53794 718 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 HECTD3Q5T447 861 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF43Q68DV7 783 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ANO7Q6IWH7 933 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TPSD1Q9BZJ3 242 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 EXOC1Q9NV70 894 aa23.92■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ALDH1A2O94788 518 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CLSTN1O94985 981 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 VNN1O95497 513 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 KCNA4P22459 653 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC6A11P48066 632 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 STK4Q13043 487 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TCEAL6Q6IPX3 200 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 HSCBQ8IWL3 235 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 MDGA1Q8NFP4 955 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TCEAL3Q969E4 200 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ANTXRLA6NF34 631 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 GRIA2P42262 883 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 MESP2Q0VG99 397 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 C12orf40Q86WS4 652 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 FUKQ8N0W3 1084 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ALLCQ8N6M5 410 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 IL17RCQ8NAC3 791 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 EDEM2Q9BV94 578 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SDCBP2Q9H190 292 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 KCTD10Q9H3F6 313 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT82Q9NSB4 513 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 INVSQ9Y283 1065 aa23.91■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 PDXKO00764 312 aa23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 AP1G2O75843 785 aa23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TNFRSF4P43489 277 aa23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 GAD2Q05329 585 aa23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 ZACNQ401N2 412 aa23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM92Q6UXU6 159 aa23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 SFTPA1Q8IWL2 248 aa23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TRDMT1-211ENST00000495022 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms