RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 MAGEB5Q9BZ81 275 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 C2CD2Q9Y426 696 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 KRT15P19012 456 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 BBS9Q3SYG4 887 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CCDC14Q49A88 953 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 PPIL6Q8IXY8 311 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CCDC63Q8NA47 563 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 SPDL1Q96EA4 605 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CNPY3Q9BT09 278 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 FAM167BQ9BTA0 163 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 TRABDQ9H4I3 376 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa13.44□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 APOC2P02655 101 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 BASP1P80723 227 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CA9Q16790 459 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CGB2Q6NT52 195 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 FAM47EQ6ZV65 393 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 GPR142Q7Z601 462 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 IGDCC3Q8IVU1 814 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 TTC13Q8NBP0 860 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 PYROXD1Q8WU10 500 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 TTC25Q96NG3 672 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 OSMRQ99650 979 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 MIS12Q9H081 205 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 ADAMTS10Q9H324 1103 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 STK38LQ9Y2H1 464 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 AKAP5P24588 427 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 GCKP35557 465 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 GRM5P41594 1212 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 DPYSL3Q14195 570 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 DUSP28Q4G0W2 176 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 TLDC1Q6P9B6 456 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CATSPER4Q7RTX7 472 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 C7orf31Q8N865 590 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 KCNV2Q8TDN2 545 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 FBXO41Q8TF61 875 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 MAML3Q96JK9 1138 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 UBN1Q9NPG3 1134 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 GRID1Q9ULK0 1009 aa13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 FAM47DPA6NHR8 397 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 OAS1P00973 400 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 PDGFRBP09619 1106 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 TAC1P20366 129 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 IL4RP24394 825 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 ACVR2BQ13705 512 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 HIC1Q14526 733 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CCDC33Q8N5R6 958 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 FBXO36Q8NEA4 188 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 AGAP11Q8TF27 550 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CLEC4CQ8WTT0 213 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 KLK14Q9P0G3 267 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 RABGEF1Q9UJ41 708 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 COL1A2P08123 1366 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 MCF2LO15068 1137 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 PRPSAP2O60256 369 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 ENDOD1O94919 500 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 UBOX5O94941 541 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 ANP32DO95626 131 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 PCK1P35558 622 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 ARL4CP56559 192 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 CEP128Q6ZU80 1094 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 OR6B3Q8NGW1 331 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 RSAD1Q9HA92 442 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 SLC12A4Q9UP95 1085 aa13.42□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 H7C0C1 242 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 MGRN1O60291 552 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 DIAPH2O60879 1101 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 AVILO75366 819 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 ATP5OP48047 213 aa13.41□□□□□ -0.26
PRAME-213ENST00000492657 SLC1A5Q15758 541 aa13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms