RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489853.1

SNRNP40-206, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 1,928 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-206	ENST00000489853	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MED30	Q96HR3	178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	FLT1	P17948	1338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MYMK	A6NI61	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TM9SF1	O15321	606 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CRTAM	O95727	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CHEK2	O96017	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ADH1C	P00326	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	INHBB	P09529	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CHRNB1	P11230	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	FGFR1	P11362	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	UBL4A	P11441	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CHRNB2	P17787	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KRT15	P19012	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ADORA1	P30542	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ACADSB	P45954	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ITGA8	P53708	1063 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC5A3	P53794	718 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	WNT7B	P56706	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	JAM2	P57087	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	OVGP1	Q12889	678 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PTK6	Q13882	451 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CCNI	Q14094	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	LRP8	Q14114	963 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ACAP1	Q15027	740 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ESX1	Q8N693	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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