RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 USP3Q9Y6I4 520 aa21.62■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 PATJQ8NI35 1801 aa21.62■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 OLFM2O95897 454 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 TCF3P15923 654 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 PLA2G4AP47712 749 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 SLC7A9P82251 487 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 RAB41Q5JT25 222 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 GJB7Q6PEY0 223 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 TFAP2BQ92481 460 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 LGALS16A8MUM7 142 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 M0QYV0 167 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 GNA15P30679 374 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 USP8P40818 1118 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 TPM4P67936 248 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 APBA1Q02410 837 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 PRKCQQ04759 706 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 PDE4CQ08493 712 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 KCNMA1Q12791 1236 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 PKDCCQ504Y2 493 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 FBXL6Q8N531 539 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 SLC22A12Q96S37 553 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CA14Q9ULX7 337 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CCL26Q9Y258 94 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CYP26A1O43174 497 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 UCHL3P15374 230 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 BPIFB4P59827 614 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 PTK2Q05397 1052 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 NACA2Q9H009 215 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 GLULP15104 373 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 TKTL1P51854 596 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 UBXN1Q04323 297 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 USP4Q13107 963 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 ZNF77Q15935 545 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 UBA3Q8TBC4 463 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 MSANTD3Q96H12 275 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CYLDQ9NQC7 956 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-208ENST00000489850 KRBA1A5PL33 1030 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 ARNTLO00327 626 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 COCHO43405 550 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 THAP12O43422 761 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 TLR5O60602 858 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 ZBED1O96006 694 aa21.57■■□□□ 1.04
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NOM1-208ENST00000489850 STARD6P59095 220 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 MTF1Q14872 753 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 PDGFRLQ15198 375 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 ZNF276Q8N554 614 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 HSFY1Q96LI6 401 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 STK33Q9BYT3 514 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 RNF38Q9H0F5 515 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 NAGPAQ9UK23 515 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NOM1-208ENST00000489850 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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