RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		18.31	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PMM2	O15305	246 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC192	P0DO97	292 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX9	P48436	509 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	GCLM	P48507	274 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	NDST1	P52848	882 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	STX17	P56962	302 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	GAS6	Q14393	721 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PON2	Q15165	354 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TTI2	Q6NXR4	508 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF276	Q8N554	614 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	OBSL1	O75147	1896 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		18.3	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP54	Q96N23	3096 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CILP	O75339	1184 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	GJA4	P35212	333 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNA2D1	P54289	1103 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ACOT1	Q86TX2	421 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RIN3	Q8TB24	985 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	MED10	Q9BTT4	135 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF292	O60281	2723 aa		18.29	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	E2F8	A0AVK6	867 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	LEFTY2	O00292	366 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN5	O00501	218 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	AP1G2	O75843	785 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	MXI1	P50539	228 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC5A3	P53794	718 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CETN1	Q12798	172 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	STX1A	Q16623	288 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR44	Q5JSH3	913 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	HECTD3	Q5T447	861 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	LONP2	Q86WA8	852 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO32	Q969P5	355 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CHFR	Q96EP1	664 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNK16	Q96T55	309 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF38	Q9H0F5	515 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB20	Q9NX57	234 aa		18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424		K7ESF4	209 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP3	O75074	770 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM200B	P0CF97	657 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	ARSA	P15289	507 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	RAP1GAP	P47736	663 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PSEN1	P49768	467 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	GALK1	P51570	392 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXK2	Q01167	660 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SATB1	Q01826	763 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CD101	Q93033	1021 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SMO	Q99835	787 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT82	Q9NSB4	513 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	SCML2	Q9UQR0	700 aa		18.27	■□□□□ 0.52
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRD	P23468	1912 aa		18.27	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		18.27	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0A0MRY4	1105 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM49	P0CI25	452 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM49C	P0CI26	452 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ZXDB	P98169	803 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	WHAMM	Q8TF30	809 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CPQ	Q9Y646	472 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		18.26	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SDHB	P21912	280 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms