RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	GNA14	O95837	355 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TCF3	P15923	654 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	BMP6	P22004	513 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TUB	P50607	506 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	LRMP	Q12912	555 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	NR1H3	Q13133	447 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CUL2	Q13617	745 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	NT5C1B	Q96P26	610 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CYP26A1	O43174	497 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	COCH	O43405	550 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	BEST1	O76090	585 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	OLFM2	O95897	454 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CHRNB1	P11230	501 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CD19	P15391	556 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	EML3	Q32P44	896 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404		Q6ZS52	159 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TATDN2	Q93075	761 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	HINFP	Q9BQA5	517 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TLR5	O60602	858 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	IRF1	P10914	325 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	GJA4	P35212	333 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	RAD23B	P54727	409 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	FZD5	Q13467	585 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TSSK4	Q6SA08	328 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF38	Q9H0F5	515 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	P4HA2	O15460	535 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	ADH1C	P00326	375 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CXCL12	P48061	93 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	BCAT1	P54687	386 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	NRL	P54845	237 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SATB1	Q01826	763 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CCIN	Q13939	588 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	CD101	Q93033	1021 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23

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