RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	CILP	O75339	1184 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	OLFM2	O95897	454 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	HLA-DRA	P01903	254 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	LRG1	P02750	347 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	KRT19	P08727	400 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	CPB1	P15086	417 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	TCF3	P15923	654 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	CYP2F1	P24903	491 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	ELF1	P32519	619 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	STX17	P56962	302 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	TSPY1	Q01534	308 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	USP4	Q13107	963 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	FZD5	Q13467	585 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	GAB4	Q2WGN9	574 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	MIIP	Q5JXC2	388 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	CEP135	Q66GS9	1140 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	METTL23	Q86XA0	190 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	FUK	Q8N0W3	1084 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF276	Q8N554	614 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	MLKL	Q8NB16	471 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	PRSS33	Q8NF86	280 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	C8orf48	Q96LL4	319 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	KXD1	Q9BQD3	176 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	SYT15	Q9BQS2	421 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	SIX2	Q9NPC8	291 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	ACP6	Q9NPH0	428 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	OBP2A	Q9NY56	170 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	GCNT4	Q9P109	453 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CUX1-208	ENST00000485792	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	BICDL2	A1A5D9	508 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM221	A6NGB7	291 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792		M0R296	226 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	EPHB6	O15197	1021 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	PI15	O43692	258 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	GREM1	O60565	184 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	FGF19	O95750	216 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	SRF	P11831	508 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	CCDC130	P13994	396 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	PFKL	P17858	780 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	VIPR2	P41587	438 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	ALDH1A3	P47895	512 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	FMO5	P49326	533 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	EPHB3	P54753	998 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	NLRP12	P59046	1061 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	STARD6	P59095	220 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	CBLB	Q13191	982 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	NCAPH	Q15003	741 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	TEAD2	Q15562	447 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	DDR2	Q16832	855 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF699	Q32M78	642 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	GJB7	Q6PEY0	223 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	VIT	Q6UXI7	678 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792		Q6ZVU0	165 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	MTSS1L	Q765P7	747 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	ITIH5	Q86UX2	942 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	FAM35A	Q86V20	835 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	MEIOB	Q8N635	442 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	C12orf29	Q8N999	325 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	GIPC2	Q8TF65	315 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	NELFB	Q8WX92	580 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	SMARCD2	Q92925	531 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CUX1-208	ENST00000485792	SMO	Q99835	787 aa		6.08	□□□□□ -1.44

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