RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 SLC9A1P19634 815 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TUBP50607 506 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 MIIPQ5JXC2 388 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 KCNH6Q9H252 994 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SCML2Q9UQR0 700 aa21.95■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 O00370 1275 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CYP26A1O43174 497 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PI15O43692 258 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 KRT5P13647 590 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CD72P21854 359 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 KIF11P52732 1056 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 MFAP3P55082 362 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SLC7A9P82251 487 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 HECTD3Q5T447 861 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PIGZQ86VD9 579 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 MSANTD3Q96H12 275 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PRRX2Q99811 253 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 RNF38Q9H0F5 515 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CPQQ9Y646 472 aa21.94■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 MAN2B1O00754 1011 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TCF3P15923 654 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PON1P27169 355 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ZNF132P52740 706 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 MYL5Q02045 173 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TYRO3Q06418 890 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TNK2Q07912 1038 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 GJB7Q6PEY0 223 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 NACA2Q9H009 215 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 GKN1Q9NS71 199 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 COCHO43405 550 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SETSIPP0DME0 302 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 GLULP15104 373 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PDE4CQ08493 712 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 STILQ15468 1287 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TRIM68Q6AZZ1 485 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TTC8Q8TAM2 541 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TFAP2BQ92481 460 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 LEFTY2O00292 366 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TLR5O60602 858 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 IFNAR2P48551 515 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 NUBP1P53384 320 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 APBA1Q02410 837 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PDGFRLQ15198 375 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP44Q17R89 818 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 EBF3Q9H4W6 596 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 USP3Q9Y6I4 520 aa21.91■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 M0QYV0 167 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TPM2P07951 284 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PTMSP20962 102 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 SOX9P48436 509 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PGFP49763 221 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 PSEN1P49768 467 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ZXDBP98169 803 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 RUNX3Q13761 415 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 UBA3Q8TBC4 463 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 FAM3CQ92520 227 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 NELL2Q99435 816 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 HPS4Q9NQG7 708 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 FANCLQ9NW38 375 aa21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
NELFE-208ENST00000481121 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.2 ms