RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 HECTD3Q5T447 861 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 LAIR1Q6GTX8 287 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PGBD3Q8N328 593 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 NAT16Q8N8M0 369 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TMC2Q8TDI7 906 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DMAC2Q9NW81 257 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 GMIPQ9P107 970 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 HPSEQ9Y251 543 aa8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 THADAQ6YHU6 1953 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SOBPA7XYQ1 873 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DCLK1O15075 740 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CETN3O15182 167 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 COCHO43405 550 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 AKAP3O75969 853 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 MYL1P05976 194 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FAM200BP0CF97 657 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 EPB41P11171 864 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TDGF1P13385 188 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TIE1P35590 1138 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SLC6A11P48066 632 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PPP3CCP48454 512 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SLC5A3P53794 718 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 LMNB2Q03252 620 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DPYDQ12882 1025 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZACNQ401N2 412 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ANO7Q6IWH7 933 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FUKQ8N0W3 1084 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 BHMTQ93088 406 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TSG101Q99816 390 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FRYLO94915 3013 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PQ27 194 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PQ64 194 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1W2PQD8 194 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ANTXRLA6NF34 631 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CYP26A1O43174 497 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K13O43283 966 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 BEST1O76090 585 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 RHOBTB3O94955 611 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SMC2O95347 1197 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ADH1CP00326 375 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 APODP05090 189 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CYP17A1P05093 508 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 HMBSP08397 361 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FAM163BP0C2L3 166 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ADH5P11766 374 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 WASP42768 502 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ASPAP45381 313 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 SLC7A9P82251 487 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ZXDBP98169 803 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PPP3CAQ08209 521 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 LRMPQ12912 555 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DMC1Q14565 340 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DHCR24Q15392 516 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 FBXO43Q4G163 708 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 EMC10Q5UCC4 262 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 KBTBD6Q86V97 674 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-209ENST00000480420 ALLCQ8N6M5 410 aa8.54□□□□□ -1.04
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