RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479155.1

LLGL1-202, Transcript of LLGL1, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LLGL1, Length 6,004 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1-202ENST00000479155 HASPINQ8TF76 798 aa14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 SPACA6W5XKT8 324 aa14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ALBP02768 609 aa14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ERVK-24P63145 666 aa14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 EFEMP1Q12805 493 aa14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 TCF3P15923 654 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 SEC24CP53992 1094 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 FICDQ9BVA6 458 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 URODP06132 367 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 SERPINB5P36952 375 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 LHX1P48742 406 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 SLC16A1P53985 500 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 BFSP2Q13515 415 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 PHKG1Q16816 387 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 WHRNQ9P202 907 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 A0A087X0T9 212 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 FAM228BP0C875 321 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 VCLP18206 1134 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CYP24A1Q07973 514 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ERO1BQ86YB8 467 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 PNKPQ96T60 521 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 M0R3G1 203 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 USP1O94782 785 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 THP07101 528 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 USP18Q9UMW8 372 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 LRRC6Q86X45 466 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CKMP06732 381 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 RHOCP08134 193 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 HSPA13P48723 471 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 NUMBP49757 651 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 TMC2Q8TDI7 906 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 GMCL1Q96IK5 515 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 IL25Q9H293 177 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 VPS28Q9UK41 221 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 PLAGL2Q9UPG8 496 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 SLC12A8A0AV02 714 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CRTAMO95727 393 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 RFX3P48380 749 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 PTPAQ15257 358 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ZNF284Q2VY69 593 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CNBD2Q96M20 576 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 YME1L1Q96TA2 773 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ENDOD1O94919 500 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ITGALP20701 1170 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 PLIN5Q00G26 463 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CYP51A1Q16850 503 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 DDI1Q8WTU0 396 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 KAT2BQ92831 832 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 CLPBQ9H078 707 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 TMEM245Q9H330 911 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.92□□□□□ -0.02
LLGL1-202ENST00000479155 RHOAP61586 193 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms