RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 GJC1P36383 396 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SLC8A3P57103 927 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 CDO1Q16878 200 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SMYD5Q6GMV2 418 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 STK32AQ8WU08 396 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 MTRRQ9UBK8 725 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM59LQ9UK28 342 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SCINQ9Y6U3 715 aa18.99■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 OR6C75A6NL08 312 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 H0YGN5 161 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SSR1P43307 286 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 RPL34P49207 117 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 GLUD2P49448 558 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 TAS2R40P59535 323 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ERVFC1P60507 584 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ATP11AP98196 1134 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 DSG1Q02413 1049 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 GPR17Q13304 367 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 MTMR3Q13615 1198 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 MGAT5BQ3V5L5 792 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 C4orf50Q6ZRC1 276 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 RXFP2Q8WXD0 754 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PIK3R5Q8WYR1 880 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ALG3Q92685 438 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 HSFY1Q96LI6 401 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 AMFRQ9UKV5 643 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 YJEFN3A6XGL0 299 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 E7ENQ6 273 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SPOPO43791 374 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SEC24AO95486 1093 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 USP46P62068 366 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 MSANTD4Q8NCY6 345 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 GIPC2Q8TF65 315 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 FAM149B1Q96BN6 582 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 KLHL11Q9NVR0 708 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PTPRDP23468 1912 aa18.98■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 H7C4K7 107 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PROSCO94903 275 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 BMPR1AP36894 532 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 GOLGA1Q92805 767 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SNX12Q9UMY4 172 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 KCNK3O14649 394 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PDGFRAP16234 1089 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PSMA2P25787 234 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 RPS6KA1Q15418 735 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 CFAP221Q4G0U5 840 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 DCAF12L1Q5VU92 463 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 KCTD13Q8WZ19 329 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 OSBPL9Q96SU4 736 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 AAASQ9NRG9 546 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 WDR35Q9P2L0 1181 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SAR1BQ9Y6B6 198 aa18.97■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC151A5D8V7 595 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 TEX28O15482 410 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 URODP06132 367 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SLC5A3P53794 718 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 KRT17Q04695 432 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 BRD3Q15059 726 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 RAB41Q5JT25 222 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 C11orf63Q6NUN7 778 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 EDEM1Q92611 657 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 HES6Q96HZ4 224 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 C2CD4BA6NLJ0 364 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 HIDE1A8MVS5 230 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 TNFRSF10BO14763 440 aa18.96■□□□□ 0.63
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC14Q49A88 953 aa18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms