RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474346.1

TNS3-211, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 775 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-211ENST00000474346 F8VP50 259 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ABL1P00519 1130 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 IDEP14735 1019 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 SLC6A11P48066 632 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 USP46P62068 366 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 GRIN1Q05586 938 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 TAF10Q12962 218 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 CCDC142Q17RM4 750 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ARMCX6Q7L4S7 300 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 EPSTI1Q96J88 318 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 CBWD1Q9BRT8 395 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 CAPN10Q9HC96 672 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D7Q9P0N9 293 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 DEC1Q9P2X7 70 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 SUSD2Q9UGT4 822 aa13.92□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ATP8B3O60423 1300 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 A0A1W2PQD8 194 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ARHGAP33O14559 1287 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 HCRTO43612 131 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 PDGFRBP09619 1106 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ITPKAP23677 461 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 YWHAQP27348 245 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 TUBP50607 506 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 RING1Q06587 406 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ZNF33AQ06730 810 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 SDE2Q6IQ49 451 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 HS2ST1Q7LGA3 356 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 NUP93Q8N1F7 819 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 LRRC27Q9C0I9 530 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 PCIF1Q9H4Z3 704 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 PANK4Q9NVE7 773 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 COMMD8Q9NX08 183 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 SMPD4Q9NXE4 827 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 STARD13Q9Y3M8 1113 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 SPEGQ15772 3267 aa13.91□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 IGF2RP11717 2491 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 ADAM23O75077 832 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 NTSR1P30989 418 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 CASP5P51878 434 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 TNNC1P63316 161 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 KDSRQ06136 332 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 MDH1BQ5I0G3 518 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 HECTD3Q5T447 861 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 EMC10Q5UCC4 262 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 SNX30Q5VWJ9 437 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 C12orf40Q86WS4 652 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 MINDY1Q8N5J2 469 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 TERB1Q8NA31 727 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 OR6B3Q8NGW1 331 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 KLK13Q9UKR3 277 aa13.9□□□□□ -0.18
TNS3-211ENST00000474346 AKAP13Q12802 2813 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 PCNX2A6NKB5 2137 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 HOXB2P14652 356 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 GABRG2P18507 467 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 PDCP20941 246 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 PI4KAP42356 2102 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 CUL4AQ13619 759 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 C10orf76Q5T2E6 689 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 USP49Q70CQ1 688 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 PROSER1Q86XN7 944 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 FRMD1Q8N878 549 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 FOXJ1Q92949 421 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 FBXO32Q969P5 355 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 CEP192Q8TEP8 1941 aa13.89□□□□□ -0.19
TNS3-211ENST00000474346 ASPMQ8IZT6 3477 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms