RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469271.1

NOM1-203, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 1,209 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-203ENST00000469271 USP3Q9Y6I4 520 aa21.62■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 PATJQ8NI35 1801 aa21.62■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 OLFM2O95897 454 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 TCF3P15923 654 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 PLA2G4AP47712 749 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 SLC7A9P82251 487 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 RAB41Q5JT25 222 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 GJB7Q6PEY0 223 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 TFAP2BQ92481 460 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 LGALS16A8MUM7 142 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 M0QYV0 167 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 BRD2P25440 801 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 GNA15P30679 374 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 USP8P40818 1118 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 TPM4P67936 248 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 APBA1Q02410 837 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 PRKCQQ04759 706 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 PDE4CQ08493 712 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 KCNMA1Q12791 1236 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 PKDCCQ504Y2 493 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 FBXL6Q8N531 539 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 SLC22A12Q96S37 553 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CA14Q9ULX7 337 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CCL26Q9Y258 94 aa21.6■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CYP26A1O43174 497 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 UCHL3P15374 230 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 BPIFB4P59827 614 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 PTK2Q05397 1052 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 NACA2Q9H009 215 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa21.59■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 GLULP15104 373 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 TKTL1P51854 596 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 UBXN1Q04323 297 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 USP4Q13107 963 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 ZNF77Q15935 545 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 UBA3Q8TBC4 463 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 MSANTD3Q96H12 275 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CYLDQ9NQC7 956 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.58■■□□□ 1.05
NOM1-203ENST00000469271 KRBA1A5PL33 1030 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 ARNTLO00327 626 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 COCHO43405 550 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 THAP12O43422 761 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 TLR5O60602 858 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 ZBED1O96006 694 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 RALAP11233 206 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 ATP1A3P13637 1013 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 CLCN5P51795 746 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 STARD6P59095 220 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 MTF1Q14872 753 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 PDGFRLQ15198 375 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 ZNF276Q8N554 614 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 HSFY1Q96LI6 401 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 STK33Q9BYT3 514 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 RNF38Q9H0F5 515 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 NAGPAQ9UK23 515 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.57■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NOM1-203ENST00000469271 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms