RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCAMP5Q8TAC9 235 aa19.33■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC2A14Q8TDB8 520 aa19.33■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCDC34Q96HJ3 373 aa19.33■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IMPG2Q9BZV3 1241 aa19.33■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYH10P35580 1976 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ENPEPQ07075 957 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADAM9Q13443 819 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ERMP1Q7Z2K6 904 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CRYBG2Q8N1P7 616 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KIAA1958Q8N8K9 716 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZMIZ2Q8NF64 920 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TAS1R2Q8TE23 839 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMOQ99835 787 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MMRN2Q9H8L6 949 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM49BQ9NUQ9 324 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IL37Q9NZH6 218 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CFAP97Q9P2B7 532 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 USP18Q9UMW8 372 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC8A2Q9UPR5 921 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COCHO43405 550 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TGM1P22735 817 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FOXK2Q01167 660 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 INCA1Q0VD86 236 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PNOCQ13519 176 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BECN1Q14457 450 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C12orf29Q8N999 325 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TWNKQ96RR1 684 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TMEM8AQ9HCN3 771 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PARD6AQ9NPB6 346 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 COMMD8Q9NX08 183 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GMIPQ9P107 970 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM92AA1XBS5 289 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BEST1O76090 585 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYP17A1P05093 508 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RETP07949 1114 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OPRD1P41143 372 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PXNP49023 591 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TUBP50607 506 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MAP3K7CLP57077 242 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GAB4Q2WGN9 574 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EDRF1Q3B7T1 1238 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HECTD3Q5T447 861 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SNX30Q5VWJ9 437 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CEP68Q76N32 757 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NIF3L1Q9GZT8 377 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYP3A43Q9HB55 503 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DLL3Q9NYJ7 618 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LAMA1P25391 3075 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM200BP0CF97 657 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADORA2BP29275 332 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LMNB2Q03252 620 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPEM2Q0P670 501 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DHCR24Q15392 516 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ACDQ96AP0 544 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EEF2KMTQ96G04 330 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DCBLD2Q96PD2 775 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HHIPQ96QV1 700 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NT5C1AQ9BXI3 368 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCSER2Q9H7U1 834 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RMND1Q9NWS8 449 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EML5Q05BV3 1969 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EPB41P11171 864 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CD58P19256 250 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GTF2H1P32780 548 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRT39Q6A163 491 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CLEC20AQ6ZU45 233 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SYT13Q7L8C5 426 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CAMKK1Q8N5S9 505 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCDC150Q8NCX0 1101 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GAB3Q8WWW8 586 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FBXO44Q9H4M3 255 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPAG17Q6Q759 2223 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 E2F8A0AVK6 867 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms