RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 HINFPQ9BQA5 517 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 REV3LO60673 3130 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PI4K2BG5E9Z4 385 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGEF15O94989 841 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 GPD1P21695 349 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ACADSBP45954 432 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TAP1Q03518 808 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PSMD5Q16401 504 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC181Q5TID7 509 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 AP1M1Q9BXS5 423 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ZWILCHQ9H900 591 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CHST7Q9NS84 486 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SPG21Q9NZD8 308 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR27A2RRH5 827 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TADA3O75528 432 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 RAB41Q5JT25 222 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 HERVK_113Q902F9 699 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 HERPUD2Q9BSE4 406 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SZT2Q5T011 3432 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MTMR11A4FU01 709 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 LAG3P18627 525 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC1A1P43005 524 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 DUSP4Q13115 394 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TEX35Q5T0J7 233 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 DEFB106AQ8N104 65 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 VPS52Q8N1B4 723 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 FIBCD1Q8N539 461 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MYO9BQ13459 2157 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TLL1O43897 1013 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 FGGP02679 453 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SOD2P04179 222 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 FYNP06241 537 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CTNNA2P26232 953 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAM32Q8TC27 787 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 EDEM1Q92611 657 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PEBP4Q96S96 227 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 INSL6Q9Y581 213 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC66A2RUB6 948 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 OR6C75A6NL08 312 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CTAGE8P0CG41 777 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MIPP30301 263 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC5A3P53794 718 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 DAOAP59103 153 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 USP46P62068 366 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM193AP78312 1265 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ROR1Q01973 937 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 DCAF6Q58WW2 860 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PBKQ96KB5 322 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 COX16Q9P0S2 106 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 TRANK1O15050 2925 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 FGF18O76093 207 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBED1O96006 694 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 RWDD2BP57060 319 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 GPR17Q13304 367 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 MTMR3Q13615 1198 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 CEP112Q8N8E3 955 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms