RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 CHMP2BQ9UQN3 213 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 DTNAQ9Y4J8 743 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PYGMP11217 842 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 GARTP22102 1010 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PTK6Q13882 451 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PCSK7Q16549 785 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 SV2AQ7L0J3 742 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PRELID2Q8N945 189 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ARHGEF3Q9NR81 526 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 TAGLN3Q9UI15 199 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 DPPA5A6NC42 116 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ADCY3O60266 1144 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 DSG3P32926 999 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 HADHAP40939 763 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 RARRES1P49788 294 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 RPS6KA3P51812 740 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PDK1Q15118 436 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ANO4Q32M45 955 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 MTHFD1LQ6UB35 978 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 MPZL3Q6UWV2 235 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 LRRC6Q86X45 466 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PPIL6Q8IXY8 311 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PIK3R5Q8WYR1 880 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 BHMTQ93088 406 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 NCLNQ969V3 563 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 SPATA17Q96L03 361 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 MTMR9Q96QG7 549 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 KLHL4Q9C0H6 718 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ZNF197O14709 1029 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 MAP3K6O95382 1288 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 SGPL1O95470 568 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 CLPTM1O96005 669 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 MYL2P10916 166 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 INSRRP14616 1297 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 SLC26A2P50443 739 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ST8SIA6P61647 398 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 TWF1Q12792 350 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ACVR2BQ13705 512 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 MYBPC2Q14324 1141 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 C10orf120Q5SQS8 335 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 EGFL6Q8IUX8 553 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 FAM13CQ8NE31 585 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 OSMRQ99650 979 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 TRPV6Q9H1D0 765 aa10.36□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 TMEM247A6NEH6 219 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PIK3CDO00329 1044 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 VWA5AO00534 786 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 CXCL11O14625 94 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PLSCR1O15162 318 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ENTPD5O75356 428 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ASMTLO95671 621 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 TGFB3P10600 412 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 SERPINB9P50453 376 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 COPAP53621 1224 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 GALNT15Q8N3T1 639 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 THAP11Q96EK4 314 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 OLFML3Q9NRN5 406 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.753e-9■■■□□ 16.8
TNS1-209ENST00000446688 PAK5Q9P286 719 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 SMIM22K7EJ46 135 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 CYTH3O43739 400 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ALDH1A3P47895 512 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 CNTN2Q02246 1040 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PDK4Q16654 411 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 MIB1Q86YT6 1006 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 FITM2Q8N6M3 262 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 LRRC57Q8N9N7 239 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 STKLD1Q8NE28 680 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 DCLK3Q9C098 648 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 MUC3BQ9H195 1237 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 DNAJC18Q9H819 358 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 LATS2Q9NRM7 1088 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ADM5C9JUS6 153 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 FAM86B1E9PN63 330 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 M0QYT0 321 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 FAM86B2P0C5J1 330 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 STAG3L1P0CL83 205 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 IRF1P10914 325 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 KCNA2P16389 499 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 UGP2Q16851 508 aa10.35□□□□□ -0.75
TNS1-209ENST00000446688 Q4G0T1 1027 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms