RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 IGF2RP11717 2491 aa15.88■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 ZZEF1O43149 2961 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 PIK3CAP42336 1068 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 GCLMP48507 274 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 DMC1Q14565 340 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 ELF2Q15723 593 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 EML3Q32P44 896 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 SDHAF4Q5VUM1 108 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 RNF43Q68DV7 783 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 TCEAL6Q6IPX3 200 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 MLKLQ8NB16 471 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 TMC2Q8TDI7 906 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 CD101Q93033 1021 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 TCEAL3Q969E4 200 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 HPDLQ96IR7 371 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 SLC22A12Q96S37 553 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 EDEM2Q9BV94 578 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 GCNT4Q9P109 453 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 DACH1Q9UI36 760 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.87■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 GABRDO14764 452 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 MAPK13O15264 365 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 RHOBTB1O94844 696 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 USP17L7P0C7H9 530 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 CYP2F1P24903 491 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 IFNAR2P48551 515 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 MYL6P60660 151 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 MYL7Q01449 175 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 PPP3CAQ08209 521 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 MYO1EQ12965 1108 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 DDR2Q16832 855 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 ZNF699Q32M78 642 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 CEP63Q96MT8 703 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.86■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 LNP1A1A4G5 178 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 HUS1O60921 280 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 CST3P01034 146 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 CKMP06732 381 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 MXI1P50539 228 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 TNNC1P63316 161 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 NCOA4Q13772 614 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 CCDC142Q17RM4 750 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 C1orf220Q5T0J3 134 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 PMS2CLQ68D20 193 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 SV2AQ7L0J3 742 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 C11orf74Q86VG3 221 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 OSTM1Q86WC4 334 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 RASSF3Q86WH2 238 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 MMS19Q96T76 1030 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 PCNX2A6NKB5 2137 aa15.85■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 DCLK1O15075 740 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 VNN1O95497 513 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 HLA-DRAP01903 254 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 PFKLP17858 780 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 PTMSP20962 102 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 PCSK1P29120 753 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 MAGEA11P43364 429 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 AP3M2P53677 418 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 CREB5Q02930 508 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 STX1AQ16623 288 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 ZACNQ401N2 412 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 LIMS2Q7Z4I7 341 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 CEP295NLQ96MC4 621 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 GTF3C4Q9UKN8 822 aa15.84■□□□□ 0.13
CITED1-204ENST00000427412 C2orf78A6NCI8 922 aa15.83■□□□□ 0.12
CITED1-204ENST00000427412 HCRTO43612 131 aa15.83■□□□□ 0.12
CITED1-204ENST00000427412 CAVIN2O95810 425 aa15.83■□□□□ 0.12
CITED1-204ENST00000427412 PROS1P07225 676 aa15.83■□□□□ 0.12
CITED1-204ENST00000427412 LHX1P48742 406 aa15.83■□□□□ 0.12
CITED1-204ENST00000427412 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.83■□□□□ 0.12
CITED1-204ENST00000427412 GAB4Q2WGN9 574 aa15.83■□□□□ 0.12
CITED1-204ENST00000427412 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms