RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PRRG1O14668 218 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GH1P01241 217 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SARSP49591 514 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNMA1Q12791 1236 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TKFCQ3LXA3 575 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FIGNQ5HY92 759 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM9CQ8IZT9 166 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEB18Q96M61 343 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K14Q99558 947 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CHST12Q9NRB3 414 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.37□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SDR42E2A6NKP2 422 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PSTPIP1O43586 416 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGA4P13612 1032 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CALB2P22676 271 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GRK2P25098 689 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ETFBP38117 255 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL4DP49703 201 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RIN3Q8TB24 985 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2G12BQ9BX93 195 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT84Q9NSB2 600 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NMRK1Q9NWW6 199 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HBP1O60381 514 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS6KA5O75582 802 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2C9P11712 490 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MLNP12872 115 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9A5Q14940 896 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 UGT3A1Q6NUS8 523 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP8B4Q8TF62 1192 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF333Q96JL9 665 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TMCC3Q9ULS5 477 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP6O75344 327 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 C4BPBP20851 252 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB5P36952 375 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HARS2P49590 506 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GEMP55040 296 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVK-24P63145 666 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CUL2Q13617 745 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SIKE1Q9BRV8 207 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SLCO1B7G3V0H7 640 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 M0QYT0 321 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K6O95382 1288 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GZMAP12544 262 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 AQP5P55064 265 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 HOMEZQ8IX15 550 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC7Q99615 494 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNH7Q9NS40 1196 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ERAP1Q9NZ08 941 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP10Q9Y6W6 482 aa11.36□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 PNPLA4P41247 253 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 FUT11Q495W5 492 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 UNC45BQ8IWX7 931 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 JADE3Q92613 823 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 YIPF2Q9BWQ6 316 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 WHRNQ9P202 907 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS26AO75436 327 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 UBOX5O94941 541 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC2A3P11169 496 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF6P49848 677 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM62Q0P6H9 643 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms