RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA17Q96L03 361 aa10.07□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
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HDLBP-211ENST00000425989 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 MARCH5Q9NX47 278 aa10.07□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 FNIP2Q9P278 1114 aa10.07□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 MTRRQ9UBK8 725 aa10.07□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 CACNG4Q9UBN1 327 aa10.07□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.07□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa10.07□□□□□ -0.8
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HDLBP-211ENST00000425989 ZNF185O15231 689 aa10.06□□□□□ -0.8
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC39A12Q504Y0 691 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 C16orf59Q7L2K0 433 aa10.06□□□□□ -0.8
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HDLBP-211ENST00000425989 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa10.06□□□□□ -0.8
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF276Q8N554 614 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa10.06□□□□□ -0.8
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HDLBP-211ENST00000425989 JOSD2Q8TAC2 188 aa10.06□□□□□ -0.8
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC2A13Q96QE2 648 aa10.06□□□□□ -0.8
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HDLBP-211ENST00000425989 ABCC13Q9NSE7 274 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-211ENST00000425989 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.81e-6■■□□□ 14
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HDLBP-211ENST00000425989 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
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HDLBP-211ENST00000425989 GOLPH3Q9H4A6 298 aa10.05□□□□□ -0.8
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