RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 MYLPFQ96A32 169 aa21.97■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 KCNK16Q96T55 309 aa21.97■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 TRIM51Q9BSJ1 452 aa21.97■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.97■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.97■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 HHLA1C9JL84 531 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 AP1G2O75843 785 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 RNF8O76064 485 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 KRT7P08729 469 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 FNTAP49354 379 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 NDUFV1P49821 464 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 COPS2P61201 443 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 FAM193AP78312 1265 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 TAZQ16635 292 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 JAMLQ86YT9 394 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 KCNJ1P48048 391 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 SLC8A3P57103 927 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 DCLK3Q9C098 648 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 HCSTQ9UBK5 93 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 NFU1Q9UMS0 254 aa21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
GPC1-202ENST00000420138 LRRD1A4D1F6 860 aa21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 FAM187AA6NFU0 413 aa21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 PTPN9P43378 593 aa21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 ATP11AP98196 1134 aa21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 RAB41Q5JT25 222 aa21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 IFT81Q8WYA0 676 aa21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 H3BQF6 201 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 CD48P09326 243 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 KDELR1P24390 212 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 SDC4P31431 198 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 HDAC4P56524 1084 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 CDO1Q16878 200 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 TFDP3Q5H9I0 405 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 DUPD1Q68J44 220 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 ABI1Q8IZP0 508 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 SLCO2A1Q92959 643 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 TTC3P53804 2025 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 NRP1O14786 923 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 DAPK3O43293 454 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 ENDOD1O94919 500 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 ARSEP51690 589 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 THEM5Q8N1Q8 247 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 ERP44Q9BS26 406 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.94■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 OAZ2O95190 189 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 FAM153BP0C7A2 387 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 TKTL1P51854 596 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 EPHB4P54760 987 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 CCNG2Q16589 344 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 FAM153CQ494X1 144 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 KAZNQ674X7 775 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 MARCH5Q9NX47 278 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.93■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 ALPK3Q96L96 1907 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 CETN2P41208 172 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 DMTNQ08495 405 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 SNX1Q13596 522 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 CUL1Q13616 776 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 EMBQ6PCB8 327 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 CAVIN3Q969G5 261 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 HSF2BPO75031 334 aa21.92■■□□□ 1.1
GPC1-202ENST00000420138 TJP3O95049 919 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms