RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 PPP3CBP16298 524 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GPD1P21695 349 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 PAX3P23760 479 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 NPTX2P47972 431 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 COPAP53621 1224 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 NXPH1P58417 271 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ITIH3Q06033 890 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ARHGEF7Q14155 803 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SLC29A2Q14542 456 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 IQCB1Q15051 598 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-207ENST00000418674 PLA1AQ53H76 456 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 FCRL6Q6DN72 434 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TAF2Q6P1X5 1199 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-207ENST00000418674 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-207ENST00000418674 TUBB3Q13509 450 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-207ENST00000418674 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.42□□□□□ -1.86
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PTPRC-207ENST00000418674 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 DKK4Q9UBT3 224 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SHOC2Q9UQ13 582 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 RAD54BQ9Y620 910 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 AQP12BA6NM10 295 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ADM5C9JUS6 153 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
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